Эффект Ивана

засилье рунглиша имеет место быть практически во всех российских конторах, и большинство даже профессиональных переводчиков средней руки, берущихся за RU-EN переводы, этим так или иначе страдают.
общий совет сформулирован уже очень давно: "переводи смыслы, но не буквы". он же по-английски: avoid word-to-word translation whenever possible. а уж как реализовывать этот совет на практике, разложить его на "мелкие частности" - это уже другой вопрос. обычно помогает только опыт, многолетняя практика, "наработка", "набивка руки". чем больше вы изучаете аутентичные источники, общаетесь с нейтивами, читаете и слушаете их язык и "продукты" этого языка, тем больше у вас средств будет впоследствии для передачи смыслов, а не букв.
об этом можно говорить часами, но это уже будет углубление в ту или иную конкретную тематику перевода, не знаю, будет ли вам это интересно.

что касается ваших примеров, то я с ними не совсем согласен.
в первом случае достаточно сказать As soon as I arrive, she leaves (или даже she's always leaving для эмоциональной окраски).
то, что написано у вас (про phases) - это уже слишком. так только если в научных работах писать.

во втором случае ваш вариант (Remove all spaces between the letters) мне кажется вполне валидным, изобретать велосипед тут не нужно. единственное, я бы letters на characters заменил, т. е. Remove all spaces between characters, или даже Remove all character spaces - в последнее время чаще в таких случаях употребляют noun adjectives.

хм... у меня дежавю?

Нет, не обязательно всегда использовать иносказательность и т. п. Очень часто бывает так, что и по-русски и по-английски предложение имеет одинаковую структуру построения.
Например с Remove all spaces between the letters нет никаких проблем - чушь тебе говорят. Just as I come, she leaves и в правду звучит кривовато. Лучше сказать She leaves as soon as I come.
А что бы подобных проблем было меньше - нужно больше читать английскую литературу. Точно та же проблема и у носителей русского языка, которые мало читают - их русский звучит криво.