Почему в слове "шёпот" пишется буква Ё,когда слышится О?

В словах "шёпот" и "шомпол" первый гласный звучит чуть по-разному.

А буква "э" вообще пришла в русский язык недавно и используется преимущественно в начале слова

)

Существует правило, регламентирующее написание этого слова. При сомнении в написании букв «О» или «Ё»: после шипящих согласных в корне под ударение пишется «Ё», если подбирается однокоренное слово с «Е». Например:
расчёска (потому что однокоренное слово – чесать);
чёрный (чернеть);
пчёлы (пчела);
пшёнка (пшено).
Под это правило подпадает и слово «шепот». Проверочным словом к нему будет «шепчет». Слово «шептать» подбирается не совсем удобно, потому что корень безударный. А вот написание «шопот» ошибочно. Это грубая орфографическая ошибка, возникающая из-за особенностей произношения. Грамматические правила не допускают писать букву «О» после шипящих в корне под ударением.
А вот если проверочного слова нет, то в корне под ударением нужно писать букву «О»: шорох, шорты, чащоба, трущоба, трещотка. В безударных слогах также пишется «О»: шоссе, жонглер, шофер, шоколад и др. https://znanieinfo.ru/orfografiya/shyopot-ili-shopot.html

И ты шептала шёпотом:
- Куда суешь, ведь }|{опа там!

Может, знаешь, почему под ударением "О" в "кирпичОм"? Есть правило?

В русской речи есть такая странная вещь, как чередование гласных. Это когда при изменении слова куда-то бесследно пропадает одна гласная, а вместо неё отчетливо слышна другая. Естественно, при этом возникает проблема с выбором нормативного написания.
Приведу один пример. Раньше (до 1956 г) слово чёрт писали чОрт (ведь там действительно мы произносим звук О). Предполагаю, что потом обратили внимание, что во множественном числе вместо О появляется звук Е - черти. И поэтому решили, что следует поменять норму и писать чЁрт, все таки Ё стоит ближе к Е, чем О.
Вот и со словом шёпот аналогичная история...

Между прочим, в нашем языке есть не менее странная (на мой взгляд, даже неприятная) вещь, как чередование ударения.
дЕрево - дерЕвья - деревЯнный.
Надеюсь, вы тут не станете задавать вопросы про ударение, например: почему говорят он нАчал, но она началА? Ведь все равно никто ничего путного не ответит...

"когда слышно "пишЭтся"?"

Так-то слышно пишИтся. Но, в зависимости от региона, могут по-разному произносить.

потому что это литературная норма, её не переделаешь

1. Есть буквы и есть фонемы.
2. В русском языке 33 буквы и 42 фонемы.
Буква это графический символ. То, что ты сейчас видишь перед собой, читая этот текст.
Фонемы - это звуковая единица языка.
3. При этом учти что количество фонем это всего лишь количество фонем в СИЛЬНОЙ позиции.
Ну, для твоего понимания, это примерно то же, что название букв.
Ты же перечисляя буквы алфавита говоришь А, Бэ, Вэ, Гэ и т. д.
Для фонем таким названием является ее звучание в СИЛЬНОЙ позиции, т. е. в той позиции, в том виде, когда они максимально различимы.
4. При этом в зависимости от того в окружении каких фонем произносится данная фонема, её звучание сильно меняется.
Такой вариант фонемы, вариант, обусловленный конкретным фонетическим окружением, называется АЛЛОФОНОМ.
Таких вариантов (аллофонов) великое множество. Сотни!
5. Более тго, всё усугубляется не только существованием в русском языке диалектов, что было бы еще полбеды, но и особенностями произношения каждого отдельного носителя русского языка, который играет с произношением как может.
Поэтому, что бы не заблудиться в этом звуковом лесу варианты произношения фонем делят на:
а) ОБЯЗАТЕЛЬНЫЕ, т. е. соответствующие некоторому на текущий момент литературному языку и действующей граматике.
б) СВОБОДНЫЕ - зависящие от предпочтений говорящего.
6. Итог. Ты забрался/забралась в дебри аллофонов, которых многие сотни и пытаешься привязать их к 33 графическим значкам письменной речи. Это первое.
Второе. Если ввести норму "пиши как слышишь", то даже в пределах класса/учебной группы вариантов сочетания букв, передающих данное слово будет как минимум несколько.

П. С. Представь себе что будет с поисковиками и словарями.
Кроме того про быстрочтение можешь забыть. От слов совсем и навсегда. Потому как взрослые люди при чтении воспринимают не отдельные буквы и слоги (это удел школоты), а целые слова и даже сочетания слов как некий единый графический образ, некие иероглифы.

П. П. С. Поэтому человечество почему то :) решило что легче научить одного писать в соответствии с принятыми для всех грамматическими правилами, чем учить всех остальных что там некто написал в соответствии со своими личными грамматическими правилами...

Проверочное слово Шепчет

можно проверить словом "шептать"- проверечное слово