Почему иногда в английском языке 3-ия форма глагола употребляеться не в Перфектном времени?

3-я
употребляеТСя
Это не время, а причастие.

Здесь это прилагательные. Включите языковую догадку: речь идет о действии или о состоянии? Если о состоянии, перед вами прилагательное.
done [dʌn]
1. прич. от do
2. прил. 1) сделанный; выполненный; законченный
all done! — всё готово!
The job is done. — Работа выполнена.
2) хорошо проваренный, прожаренный; готовый (о пище) - well done 3) (done in) усталый
Syn: tired
4) (done for) разорённый; погубленный, конченный

gone [gɔn] - в первую очередь прилагательное
1. 1) умерший, ушедший (из жизни)
Syn: dead
2) пропащий, потерянный; разорённый
gone man — пропащий, конченый человек
lost looks and gone faculties — потерянный вид и утраченные способности
Syn: lost, ruined, undone
3) характеризующийся внезапной слабостью
the gone feeling in the abdomen so common in elevators — чувство внезапной пустоты в желудке, так часто возникающее в лифтах
4) возбуждённый, охваченный (каким-л. чувством)
far gone in hysteria — охваченный истерикой
She was real gone on that man. — Она была ослеплена этим человеком.
Syn: involved, absorbed
5) в положении (о беременной) to be five months gone — быть на пятом месяце (беременности)
Syn: pregnant
6) прошлый, прошедший
memories of gone summer — воспоминания о прошедшем лете
Syn: past
7) восхитительный, великолепный
real gone fashion reporter — настоящий великолепный светский репортёр
Syn: great
И только во вторую очередь -
2. прич. от go

Вообще, если что-то непонятно, возьмите за правило сначала смотреть в словари. Там обычно все написано)

А почему она там не должна употребляться?

это идиома
как go home, хотя по-хорошему надо бы говорить go to home

she is gone - она умерла
we're done - мы справились