Эти слова имеют какую-либо глубинную связь: математика, мать, материя (maths, mother, matter)?

Матема́тика. Заимств. в начале XVIII в. из лат. яз., где mathematica < греч. mathematikē (technē) «математическое (искусство)», суф. производного от mathema «наука о величинах, знание, учение», возможно, того же корня, что мудрый

Мать (род. п. матери). Общеслав. индоевроп. характера (ср. нем. Mutter, англ. mother, др.-инд. mātár-, тохарск. A mācar и т. д.). Суф. производное (суф. -ter-) от детского ma, ср. мама.

Мате́рия. Заимств. в XVII в. из лат. яз., где materia «материя, ткань» < «строительный лес» — суф. производного от mater «мать». Ствол дерева понимался как «мать» веток. Философское значение в лат. яз. — семантическая калька греч. hylē «лес, дерево, материя» (в рус. яз. известно с XV в.).

Таким образом слово "материя" произошло от слова "мать" ещё в древние времена в латинском языке. А слово "математика никакого отношения к ним не имеет.

все слова имеют "глубинную связь"

Мафима это урок с греческого отсюда и мафиматика
Митера жто опять же мать по-греческито есть в греческом две буквы фиωφ и тета θ она же фита в латинской транскрипции соотвественно ph и th.
В слове mother th звонкая как в слове the.
В слове mathemamatics th глухая как в слове think.
Обычно h читается как простое придыхание а th передает совсем другие звуки.

Слова материя и мать связаны между собой, поскольку слово материя в русском языке заимствованно из латинского, где оно произошло от слова -mater. Это древнее индоевропейское слово в русском языке ему соответствует - матерь.

Математика же так же заимствованно из латинского, в котором в свою очередь заимствованно из греческого - manthematikos. происходит от праиндоевропейского корня - men, в значении - думать. от него же произошли такие русские слова как - мнить, мнение. а так же слово - память, где -н- тоже выпало, но вновь появляется в словах - помнить, вспоминать, запомнить итд.

Да, конечно, эти слова связаны. И связаны они щедрыми руками заимодавцев. Слово "математика" происходит из заимствования латинцев (mafeozo) заимствования древних греков (μαθηματική) у индоевропейцев (*matros). Слово "материя" также было заимствовано через эти-же мозолистые руки, и означало оно "дырявый кафтан" (от индоевропейского слова *tereti). Слово "мать", вроде-бы ставшее всем нам уже привычным и потому кажущееся своим, оказывается тоже было заимствовано через тех-же латинцев у тюрков и древних греков, которые в свою очередь заимствовали его у индоевропейцев. Так что вот такая история (вкратце).

Материя и мать однозначно имеют общее происхождение

Нет. Математика - наука о вычислении, мать - чья-нибудь мать, материя - любое вещество, например твёрдое (например пронстранство - это не материя, всё остальное - материя)