Это нормально, когда переводчик в примечаниях истекает ядом по поводу логических несостыковок в книге?

Ядом - ненормально, а обращать внимание на нестыковки- нормально.

Так он их исправил в своем переводе? Вообще странно. Если мне книга не нравится, я просто не возьмусь ее переводить.

Если яд померещится читателю, то ничего страшного.

Когда читатель любит автора больше чем переводчик ему любой анализ священного текста может показаться кощунственным .
Но здесь я так понимаю вы допускаете ошибку, потому что переводчик не занимается примечаниями, этим занимается редактор.
Или это может быть все же переводчик, который по заказу опять же редактора переводит в том числе и примечания оригинала
Но в любом случае за макет книги и ее полное содержание отвечает редактор, который в свою очередь выполняет пожелания издательства .
Ему самому тоже не обязательно составлять эти примечания .Для этого есть специалисты которым можно все это заказать разумеется за отдельную денюжку
Таким образом все упирается в бюджет

Любопытно, что за перевод, что за издание вы читали. Я сейчас проверила -- там не то что нет яда в примечаниях, там и примечаний-то такого рода, комментирующих текст, нет вообще.
В любительском переводе в основном примечания о метрическом размере того или иного упоминающегося в тексте, в изданном -- вообще 4 примечания: как будет "ни фига" по-испански и что-то еще.
Вы вообще о чем? О переводе из параллельной Вселенной?

Чаще всего это происходит в очень древних книгах там примечания иногда занимают больше места чем сам текст. ) В Сатириконе, Беовульфе или Китайский народных страшилках. Просто без дополнительных знаний иногда нельзя понять сути. Как то видил сноску к Дракуле по поводу преливания крови которое повторяли 3 раза от разный донаров а внизу сноска на тот момент группы крови не были открыты. )

Раз на раз не приходится. Только когда гл. героиня (по тексту) бродит по развалинам Зимнего после залпа Авроры, а полковник ЧК в золотых погонах кушает пельмени из тухлой оленятины (естественно под samogon) и параллельно возит красноармейцев по Иртышу в Тобольский балет на ледоколе очень хочется ругаться матом и одновременно сохранять спокойствие. Особенно когда сроки поджимают, а редактора отдела твои проблемы е.. ут в последнюю очередь.
(про текст я не шучу).

Такого не встречал. Из того, что вспомнил- в комментариях переводчик лишь выражал недоумение, откуда в рассказе (а действие происходит в дикой степи) вдруг появился казначей; ну нужен он был по сюжету, вот и появился (может в диких степях раньше казначеи сидели под каждым кустом); если что- это классическое произведение, которому чуть меньше 1000 лет

Да нормально. Особенно, если он не сам выбирает себе книгу для перевода, а это за него делает редактор или издатель по принципу - переводи или ищу другую работу.
К тому же если речь идёт о "Бегущем в лабиринте", то яд вполне оправдан - в книге позорно много дыр даже для янг-эдалта.

Сделать хороший перевод это написать книгу на 50% заново.