Можно ли тройку использовать в электричке как на МЦД?

Можно, конечно.
Для проезда по МЦД доступны все (кроме экспрессов РЭКС и в некоторой части аэроэкспрессов - от Окружной до аэропорта Шереметьево) поезда, как новые Иволги, так и старые электрички.
Одним из распространённых заблуждений является миф о том, что проезд по Тройке по МЦД возможен только на современных Иволгах, но нет. Подходят и обычные электрички - какая быстрее подойдёт. Даже если она едет далеко за пределы Лобни (например, Бородино-Икша).
А вот контролёров (по крайней мере в Центральной зоне) я с момента запуска МЦД не видел. Но даже если там они есть, проблем с ними не будет никаких.

Никаких "обычных электричек" на линиях МЦД больше нет: все поезда, работающие на этих участках, будь это привычные нам издавна ЭД-4 / ЭП2д, Иволги или Аэроэкспрессы (последние - на участке от Одинцова до Окружной), обслуживают пассажиров на условиях МЦД. Исключение - экспрессы РЭКС, на которые надо приобретать билеты отдельно (если пенсионерам Москвы - то бесплатные билеты по социальной карте), билеты и абонементы МЦД на них не действуют.

Скорее тройкой/стрелкой, они продаются в ж. д. кассах. На автобус местный ( подмосковье ) это точно действует и даже со скидкой. Тройка пополняется в метро, стрелка пополняется через ж. д. кассы. Не совсем точно знаю что так можно ездить на электричке, но ты спроси... Да, и если будешь покупать карту, не покупай брелки, стоят они дороже и теряются на раз. Во всяком случае комбинированная карта поможет тебе.