Подскажите как руководителю реагировать на сложившуюся ситуацию

пусть указания специалисту широкого профиля передает не напрямую начальник отдела, а через кого-то.. .
или пусть директор вызовет обоих и спросит напрямую, что каждого не устраивает в другом

лишении премий

Я не знаю как, наверно сделать так что бы они не пересекались. Я сама сегодня буду увольняться из за этого. Не могу с одной работать. Начальству безполезно говорить. Что я скажу? Уберите её, она меня бесит? Не скажу я так. Директор мне ответит что это мои проблемы. Тем более она очень хорошо лижет .опы, чем заслужила авторитет)

Никак. Выгнать на хер одного из них. Иначе работы вообще никакой не будет - сплошные склоки, интриги и прочий геморрой.

Тем более если они сами разрулить ситуацию не могут, значит их не жалко.

Ответ прост! Когда два человека конфликтуют я запускаю систему их рабочих взаимоотношений через себя. В этом случае гадости исключаются и рабочая схема налаживается. Затем восстанавливаю прежнюю прямую связь, но с дублированием через себя и наконец вопрос закрываю.
Как правило это вопрос энергетический. Кто то из них вампирит, второй не понимая, эмоционально реагирует и сбрасывает энергию, в связи с чем чувствует себя плохо, отсюда и реакция. Вот вампира нужно осадить, а донору обьяснить, что реакция это плохо для него. Он должен научиться не реагировать. Или делать это правильно. Как только вампир не получит энергии он сдуется или переключиться на другого.
Вот так примерно...