Проводник Windows показывает не все файлы, кроме того - нужен полный доступ к диску. Чтобы выделить действительно все файлы, нужен монопольный доступ к диску.
К тому же, каталог "System Volume Infromation" может содержать точки восстановления, и доступ к нему нужно "Разрешать" или под уч. System заходить.
http://wincmd.ru/plugring/ntfs4tc.html