Судмедэксперт и судовой врач, Есть ли в разница между ними или это одно и тоже?

Общее то, что у обоих медицинское образование.
Специфика работы совсем различная.

Судмедэксперт = патологоанатом. На самом-то деле это два разных специалиста, которые работают в разных учреждениях. Патологоанатомы работают при больницах и основная задача их – ответить на вопрос, умер ли пациент от того, от чего его лечили или нет.
Это как вообще: работать судмедэкспертом — Платформа ...
https://opinion.platfor.ma/eto-kak-sudmedekspert/

Судово́й врач — должностное лицо на судне, проводящее санитарно-гигиенические, противоэпидемические и лечебно-профилактические мероприятия.

Подчиняется только капитану. В российском флоте должность введена в начале XVIII века. С 1707 года начато обучение при московском госпитале. В СССР их готовили в Военно-морской медицинской академии в Ленинграде с 1940 по 1956 год, после расформирования этого учебного заведения был создан военно-морской факультет в Военно-медицинской академии имени С. М. Кирова, который готовит судовых врачей для гражданского и военно-морского флота по настоящее время.
Количество судовых врачей:
экипаж судна от 40 до 200 человек — 1 врач
более 200 человек — 3 врача (хирург, терапевт, стоматолог).
Для плавбаз, плавающих рыбоперерабатывающих заводов учитывают численность экипажей всей флотилии.
https://ru.wikipedia.org/wiki/Судовой_врач

Это разные вещи. Судмедэксперт работает на суд, судовой врач работает на судне, то есть на корабле.

Разница как между патологоанатомом и участковым терапевтом.

Ну, судовой врач -- это который сидит на судне, не?..

Обидно когда отучился на судового врача, а качки не переносишь:))

Ну, если врач имеет все полномочия заключить экспертизу, то разница не определяется.