Физ. лицо по декларации зарегистрировало право (св-во) на несуществующий в натуре объект недвижимости. Как это наказуемо?

Абсолютно никак не наказуемо. И регистрационная палата с БТИ здесь ни при чем, поскольку закон не обязывает вызывать БТИ для регистрации строения по декларации, гражданин вписывает размеры по своему усмотрению. Регпалата также не обязана выезжать в адрес и проверять, стоит дом, или нет: им документы сдали, госпошлину в 200 рублей оплатили, они право зарегистрировали. Даже если вдруг предположить мифическую возможность какой-либо проверки, гражданин, дом зарегистрировавший, скажет: "Когда регистрировал - дом был, а сейчас я его разобрал, просто право прекратить еще не успел". Мошенничество будет тогда, когда этот гражданин продаст кому-нибудь участок вместе с несуществующим домом, покупатели не удостоверятся, что дома нет, а деньги заплатят не как за пустой участок, а как за участок с домом. Но поговорка есть такая, "дураков и в церкви бьют" - перед тем как купить, неплохо бы удостовериться, что покупаешь именно то, на что тебе документы показывают: сходить в сельсовет, если садоводство - побеседовать с председателем правления, на худой конец, хотя бы с соседями.

виноваты БТИ и регпалата, самоуправство или злоупотребление должностными полномочиями, возможна халатность, худший вариант - мошенничество, но тут уже и при участии гражданина

Кто-то должен был дать справку, что строение не выходит за пределы участка. Либо председатель садоводства, либо кто-то из местной администрации. Если дали эту справку на несуществующее строение, значит, они и виноваты.
И назначение участка должно позволять строительство. Иначе - самоволка, ст. 222 ГК РФ.

Сам факт получения такого свидетельства ненаказуем. Но какой смысл его получать?