С какими сложностями может столкнуться владелец, если в доме у него живёт больше одной собаки?

У меня молодой неразвязанный кобель и возрастная стерильная сука. Метить ему и в голову не приходило, сука у него в непререкаемом авторитете, несмотря на то, что в два раза мельче. Бывают по мелочи стычки за игрушки, старшая возьмет у малого игрушку и демонстративно от него охраняет, а он начинает голосить, осознавая свою беспомощность перед ней. Больше времени на выгул, т. к. вывожу их отдельно (старшая любит короткие неспешные прогулки, мелкому надо гулять долго и активно, одновременно это невозможно), больше финансов на кормление, амуницию и т. п.
Развею миф о том, что вдвоем им веселее. Ничего подобного, они просто друг друга терпят. И когда никого нет, каждый спит на своем месте

это больше финансовых вложений и больше времени и сил на те же прогулки, дрессировку

Если соседка стерильная. кобель метить не начнет. К тому же этим страдают в-основном мини-и мелкие породы, не озабоченные дрессировкой и качественным выгулом.

у меня кобели-производители в одной квартире с нестерильными суками-производительницами. ни одному в голову никогда не приходило метить в доме - они качественно гуляют 3 раза в день и не приучены гадить в доме, вот и весь секрет

Дома метить могут кобели небольших пород. Чтобы метили среднеразмерные и крупные собаки - это большая редкость.
Но даже кастрированный кобель может на течную суку реагировать. Щенков он ей, разумеется, не сделает, но вот скулить, нализывать её, делать садки, сам нервничать и отказываться от еды - это он при течной суке может. Да и сука течная ему прохода давать не будет.
Если сука стерилизована, то вряд ли кобель проявит к ней интерес. Хотя встречаются такие "ароматные" дамы, которые кобелей и без течек собирают. То ли всё-таки какие-то гормоны вырабатываются, то ли просто над сукой все подряд пытаются доминировать.
Сложности скорее с выгулом возникают. По крайней мере у меня. Если собаки с разными темпераментами (одна быстро ходит - другая медленно, одна хочет играть - другой надо постоять и понюхать, одна общительная - другая конфликтная), то сложно совместить прогулки. Надо либо поочереди гулять, что занимает больше времени (получаются две прогулки, а в промежутках надо ещё первую собаку вымыть-раздеть), либо гулять как-то одновременно.
Собаки неплохо друг друга учат. Если одна собака убегает или собирает мусор, то вторая её быстро этому научит. Если одна собака с кем-то в драку лезет, то вторая вскоре образует с ней стаю и будет в замесах участвовать.
Дрессировать двух собак тоже сложнее. Особенно если собаки играют между собой, молодые и непоседливые. Им интереснее друг с другом скакать, чем хозяйские команды выполнять. Поэтому индивидуально с каждой погулять и позаниматься желательно.