Обязательно ли щенку ставить клеймо? Допустимо ли выставлять собаку без клейма, но с микрочипом

Вы как-то избирательно читаете положение. Там сказано: клеймо обязательно для собак, рожденных в РФ. А чип обязателен для собак, импортируемых в РФ.
Если речь о чистопородном животном, то вопрос ставить или не ставить клеймо даже не возникает, его ставят еще в питомнике и будущих владельцев не спрашивают.
И клеймение, и чипирование спокойно делается в домашних условиях, а не обязательно в клинике. Единственное, в чем не слукавил заводчик - чипирование менее неприятная для животного процедура.

Нет. Ответственный заволчик не спрашивает заволчика, нужно ли ставить клеймо или нет. Это делается всем, без исключения, щенкам. Выставлять или нет уже скм заводчик решает, чип для выставок не обязателен.

Клеймо обязательно, чип по желанию. Странно, что заводчик не знает такой элементарщины. И странно, что клеймить собирается в ветеринарке, заразу собирать. Клейматора приглашают на дом из клуба, откуда ветеринар может знать, кому что набивать? В клубе есть специальная должность "Ответственный за клеймение", его фамилия вписывается в общепометку и именно он отвечает за соответствие щенка, клейма и метрики.
Мутный какой-то у вас заводчик, честно скажем

Вы же покупаете собаку, как вам потом докажут, что она чистокровная. Вот продадут вам дворняжку под видом породистого и что вы будете делать? Обратно не вернуть... а деньги потрачены и не маленькие. Если идёт такой разговор, то сразу ищите другого заводчика.