могу ли я поговорить с атеистом по душам, если он не верит в существование души?

Можно говорить о чем угодно и "по душам". Все зависит от того, какой это человек, готов ли он это слушать? Поэтому, навязывать разговор о духовном от себя - не стоит, лучше подождать его слов и оценить степень его заинтересованности в разговоре на такие темы. Нужно понять - не лукавство ли это?
Почему это важно? Чтобы не навредить ни себе, ни ему. Рассказать самому об этом, человеку, не готовому к такому разговору, значит: разорить себя и вызвать раздражение у собеседника. И это раздражение еще более отдалит такого человека от Бога, но уже по вашей вине.

Для этого учиться надо.)

Вот потому и не надо, могуи обосрать тебя и твою душу, обтекая вы смотритесь лучше.

По душам - это значит отковенно.

не можешь ибо у тебя тоже нет души. просто ты веришь что она есть, равно как и веришь в выдуманного бога и его мифы

А Вам оно надо?... )
Может лучше с духовником...?

Атеизм и материализм это не одно и то же. А вы путаете.
Я материалистка. Со мной по душам вы не поговорите. Можете просто откровенно поговорить. Откровенность - это свойство характера, это бывает, как свойство.

можете поговорить душевно

Давайте отделять зерна от плевел. Почему вы решили, что мы, атеисты, не верим в существование души? Просто в слово "душа" мы вкладываем несколько иной смысл. Мы же верим в существование ума, хотя и он нематериален (не путать с мозгами).