Почему Бог не защитил от беды тот город, который 400 лет служил вратами христианства, и был полон богоугодных церквей?

Вы о Иерусалиме, Константинополе или Риме? Каждый из этих городов заслужил кару Господню. Да и людишки, там проживающие - тоже. Только наказание у всех разное. По тяжести содеянного.

Не успел.

Это было время крайнего ухода от Бога народа Божьего, а Бог не может пребывать там где Его пренебрегают. Таково было наказание за отступление.

Бог не защищает города человеческие... Он дает человеку жизнь и жизнь вечную, если находит, что человек этого достоин. А, церкви? Так, не в церквях Бог живет и не требует служения рук человеческих. Люди строили храмы для себя, вот пусть сами и защищают, если они им нужны... Сердце человека является храмом Бога, а не деревянные изделия рук человека. Может и до вас это дошло? Или дойдет, когда нибудь?

Потому что они не были богоугодными. Пророк Исаия писал о том, что Бог не все молитвы слушает и далеко не всех одобряет.

Если бы тот город ДЕЙСТВИТЕЛЬНО был полон богоугодных церквей, и если бы они ( эти церкви) действительно были угодны христианскому Богу, то ОН конечно бы защитил от беды тот город.
И где критерий богоугодности церкви Богу? Кто определяет это?

аналогично: а чем не угодили дети Беслана ?

иметь много церквей и делать вид, что все верующие, -это еще ничего не доказывает, Ему все известно, Его обмануть невозможно. Ему лучше знать как поступать.

Не заморачивайтесь.

потому что церковь от его имени, сотни лет несла войну, убийства, насилие и горе.
Инквизиция, крестовые походы, поборы служителями церквей.. . и их, за частую, распутая жизнь - разве могут быть угодны Богу?

Бог ставит человека в такие условия, которые наиболее подходят для свободного выбора лучшего. Иногда нужны беды, чтобы не было еще худших бед.