Почему Иисус не призывал последователей защищать свою местность, а дал совет бежать?

Потому, что Христос перед этим повелел. «Любите врагов ваших, благословляйте проклинающих вас, благотворите ненавидящим вас и молитесь за обижающих вас и гонящих вас» (Матфея 5:44). А ведь его Родина, Израиль, была в рабстве у Рима. Рим напал на Израиль. И почему же и Христос и христиане не воевали за Родину?

потому что зло невозможно победить ,(зло можно"победить"только ещё большим злом ),от него можно только уклониться

Единственное, что я могу предположить по этому поводу, это то, что защищая "святое место", люди начнут сражаться и убивать, а это уже нарушение заповеди.

Он знал, что это лучше

потому что это время великой скорби, о которой сказано, что если не сократятся эти дни искусственно, Богом, ради избранных, то не спасется НИКАКАЯ ПЛОТЬ.. . Речь идет о третьей мировой войне, которая разразится перед самым концом света.

А избранные, ради которых сократятся эти дни - это Его ученики, соблюдающие субботу, как День Господень. Потому что именно об этом времени Господь предупреждает Своих учеников, говоря (читайте контекст) :
20 Молитесь, чтобы не случилось бегство ваше зимою или в субботу,
21 ибо тогда будет великая скорбь, какой не было от начала мира доныне, и не будет.
22 И если бы не сократились те дни, то не спаслась бы никакая плоть; но ради избранных сократятся те дни.

Екатинбург,зри в корень -Козьма Прутков