Почему все думают что атеисты презирают верующих?

Потому что не читали атеиста Ленина. Вот что говорил по данному вопросу Ленин:
В 1919 году на запрос Бахвалова: как поступить с недостроенной (в связи с
революционными событиями в стране) в провинции церковью, Ленин ответил: "Окончание постройки храма, конечно, разрешается" (ПСС, т. 50, с. 273).
В 1920 г. в письме Орджоникидзе Ленин писал: "Ещё ` ' прошу действовать осторожно и обязательно проявлять максимум доброжелательности к мусульманам" (ПСС, т. 51, с. 175).
Точно так же в своём письме в Петроград Ленин писал о недопустимости некорректного отношения к сектантам. В 1921 г. в связи с опубликованием в газете по случаю 1-го мая лозунга: "Разоблачайте ложь религии", Ленин писал: "Это нельзя. Это нетактично. Именно по случаю пасхи надо рекомендовать иное: не разоблачать ложь, а избегать, безусловно, всякого оскорбления религии> (ПСС. т, 52, с. 140).

"...выступая на совещании беспартийных делегатов IX Всероссийского съезда Советов 26 декабря 1921 г., Ленин с обидой отреагировал на подозрение, будто он «предлагал жечь молитвенники»: «Само собой разумеется, что я никогда этой вещи не предлагал и предложить не мог. ..По основному закону нашей республики, ​свобода духовная​ насчет религии за каждым безусловно обеспечена...»
Ленин В. И. Полн. собр. соч. Т. 44. Стр. 333.

Готовя «Проект речи по аграрному вопросу во второй Государственной Думе» (1907), Ленин писал: «…мы, социал-демократы, относимся отрицательно к христианскому учению. Но, заявляя это, я считаю своим долгом сейчас же, прямо и открыто сказать, что социал-демократия борется за полную свободу совести и относится с полным уважением ко всякому искреннему убеждению в делах веры…».

"заботливо ​избегать​ всякого оскорбления чувств верующей части населения…» в указании В. М. Молотову в апреле 1921 года.

в письме к Орджоникидзе 1920 год : "обязательно проявлять максимум
доброжелательности к ​мусульманам​" (ПСС, т. 51, с. 175).

И ответ патриарха Тихона (это не фейк - написано в церковном календаре Чернозатонского) :

«Владимир Ильич Ленин не отлучен от православной церкви высшей церковной властью, и потому всякий верующий имеет право и возможность поминать его. Идейно мы с Владимиром Ильичем Лениным, конечно, расходились, но я имею сведения о нем как о человеке добрейшей и поистине христианской души.»

Патриарх Московский и всея России Тихон (Причислен к лику святых 9 октября 1989 года)

Комментарий такой - христиане не умеют вычислить антихриста, кроме очень немногих истинных верующих, например:
"во время одной из страстных речей Ленина из толпы вдруг раздался голос:

— А в бога-то ты веруешь, антихрист?

Это крикнул разгневанный священник, и Ленин тут же ему ответил с насмешкой:

— Бога бойся, царя чти, не так ли, батюшка? ..Но я царя не чту и бога не боюсь! "
http://www.bibliotekar.ru/andreeva/47.htm

Не все, а только фанатики!

Атеисты не воспринимают доктрину верующих, а верующим кажется, что их презирают.))))

Глупцы есть в каждой вере

Я несогласен. Мой покойный лучший друг был верующим, католик. Была многолетняя дружба.

Не все!
Чаще атеист выпячивает своё невежество наружу, унижая верующих разными словечками... Для поднятия своего статуса и уверенности в своеи неправоте!
;~)))))

Взаимная вещь- деление на своих и чужих.

С теми, кого презирают, не спорят. Не разговаривают более чем односложными фразами....

Это что - похоже на то, что творится в этой категории?

Я презираю не верующих, а ту чушь и ложь в которую они верят и пытаются навязывать.

Презирать верующих это всё равно, что презирать больных. Этого делать нельзя. Надо создавать условия, чтобы люди не болели. Самым лучшим лекарством от этой болезни яаляются знания и образование.

Верующим нравится рядиться в мучеников за веру....

Сама задаюсь этим вопросом всю жизнь.

Потому что атеисты от мира сего, а христиане не от мира, их мир ненавидит, в том числе и его приверженцы- атеисты, материалисты, потребители и другие лукавнующие человеки.

По их выводам.

В человеке заложено презирать кого то -по хрен кого