Как поступали с инакомыслящими, во всех веках истории человечества?

На костёр их ,

Еретиками называли и убивали

распинали.. костер или эмиграция

Ну как то так!

когда люби были дикарями поступали по дикарски. а сейчас общество более развито. еритиков предают отлучению от церкви но они вполне могут собрать свою аудиторию и продвигать свою веру свой эгрегор. именно потому столько религий и наплодилось

Или изгой или лидер.

их делали изгоями

...да как как
На луну их посылали, или на кол сажали.
Всё зависило от их пожеланий

Для общего вопроса - слишком много векторов.
Извращенцев сейчас тоже ..инакомыслящими считают..
И борятся за их права...

В Афинах Ареопаг

А это зависело от инакомыслящего. Всё в наших руках.
Самый простой пример - КПСС. Чтобы сделать карьеру в СССР нужно быть членом партии - это всем известно. И поэтому, инакомыслящий, если он не идиот, прятал свои мысли подальше, до поры до времени. Вступал в партию, нёс общепринятую ахинею про коммунизм, крах капитализма, и что бога нет. И неплохо жил, достигал больших вершин.
А когда во власти оказались все инакомыслящие - СССР рухнул.

В римской империи все равно было какого Б-га ты почитаешь-Юпитера, Аполлона или какого-нибудь Кернунноса. Под запретом были только три религии. Друиды-за человеческие жертвоприношения. Поклонники Вакха-за человеческие жертвоприношения. И христиане-"за ненависть к человечеству".
Христиане жгуче ненавидели всех, кто поклоняется другим Б-гам, кроме "ихнего" Исуса.

"...бунтующий люд репрессируют прежде, чем он начнёт бунтовать..."