Если установить на комп 2 жёсткий диск и слить его в единое целое с моим локальным диском D, будут ли проблемы?

соединить можно только при установке с удалением всех раздеров на дисках и созданием новых Raid массивов, скорость будет как на меньшем по скорости
В общем случае, падает скорость работы массива и его эффективная емкость (доступная пользователю часть объема массива из общего объема дисков в массиве). У массивов RAID0 и RAID1 скорость работы массива уменьшится до скорости работы самого медленного диска, а у каждого диска в массиве будет использоваться лишь та часть, которая равна емкости наименьшего диска в массиве. Таким образом, если в массив поставить 3 диска: один 8 Гб и 2 по 40 Гб, то в массиве RAID0 эффективная емкость будет 24 Гб, а в RAID5 - 16 Гб. Скорость работы такого массива будет обычно равна скорости самого медленного диска. В массивах RAID0 некоторые контроллеры поддерживают режим "Span" (или JBOD), когда все диски просто объединяются в один, без рассредоточения данных по дискам. В таком режиме Вы получите наибольшую эффективную емкость, но скорость работы системы будет невысокой. У RAID1 из дисков 8 и 40 Гб эффективная емкость будет 8 Гб, но скорость обычно не падает до скорости самого медленного диска, поскольку чтение и запись будет производиться с/на самый быстрый диск, а запись на медленный диск будет производиться в отложенном режиме. Но надо заметить, что это будет справедливо для записи информации небольшими порциями.

Не получится так просто объединить два физических диска...

Объединить их можно соединив в raid массив. Это нужен контроллер или функция на мат плате. А как вы их будите соединять так и будет работать вариантов много

https://ru.wikipedia.org/wiki/RAID

не сольешь.