Подскажите, может, кто знает, как в акаде отключить функцию приведения всех открываемых файлов к стандартному виду?

А что, есть такая функция?
Расскажите подробней, в первый раз слышу.

Когда чертёж, содержащий тексты открывается, вместо ненайденных (отсутствующих) файлов шрифтов *.shx подставляется тот, который указан по умолчанию, потому что надо же чем-то шрифты отобразить, худо-бедно.

Наиболее приемлемым, не затеняющим, читабельным и достаточно узким является simplex.shx, его и рекомендую
использовать в настройке
Tools - Options... -Text Editor, Dictionary and Font File Names - Alternate Font File = simplex.shx

Если спросить командой List свойства текстового примитива, который был открыт с подстановкой, то там
будет указано, какой шрифт использовался внутри файла, и каким шрифтом он заменён (substitued), а также прочие свойства, и коэффициент сжатия ширины Width.
Используя инструмент Properties можно индивидуально исправить каждый текстовый примитив.
Или исправив один примитив, можно кисточкой "перекрасить"-скопировать ВСЕ его свойства на другие текстовые примитивы, какие найдёте нужным.
И ещё один приём - создать нужные текстовые стили, и перекрасить в них неудовлетворительные тексты.

Причиной замены шрифта является или его отсутствие, или неправильная настройка.
Обычно шрифты хранятся в папке Fonts. Найдите такие папки или внутри пакета
c:\Program Files (x86)\AutoCAD 2006\Fonts\
или внутри Локальных настроек (по имени профиля пользователя) :
c:\Users\Владелец\AppData\Roaming\Autodesk\AutoCAD 2006\R16.2\enu\Fonts\
Последний путь слегка зависит от версии Windows (7).
Если там файлы есть, то такой путь должен быть также указан в настройке
Tools - Options... -Support File Search Path
и среди рабочих файлов
Tools - Options - Working Support File Search Path