Маленькое имхо...
Швеллер - изделие горячекатанное. Мало того - прошедшее термообработку: нормализацию (охлаждение на воздухе после горячей катки).
Несомненно, что в изделии после таких операций есть остаточные механические напряжения. Фрезеровкой вызвали их перераспределение и результатом явилось изменение формы. Плоскошлифовальным станком ничего не достигнете, такой же результат будет.
Можно попробовать отжечь швеллер до мех обработки - нагреть до температуры около 650 градусов (точнее надо смотреть по справочнику для стали, из которой сделан Ваш кусок) и медленно охладить. Если не "поведёт" при этой операции (вроде не должно), то потом обработать.
Учтите, что после отжига мех свойства поменяются - твёрдость уменьшится, прочность снизится (но незначительно).
https://studfiles.net/preview/2901429/page:14/