Всю ли сумму вернут?

Причина роли не играет. Смотрите в правилах возврата билетов

Смотрите условия тарифа, по которому приобретён билет, и условия страховки, если вы таковую оформляли.

Почти что в любом случае вопрос стоит не "всю ли сумму вернут? ", а "вернут ли хоть сколкьо-то? ".

вам вернут то, что оговорено в тарифе. если тариф невозвратный - не вернут ничего. авиакомпании не обязаны перед продажей билетов проводить медицинское обследование пассажиров. речь о полной компенсации может идти лишь при условии вины авиакомпании

В связи с операцией мне пришлось сдать билеты - вот все штрафы и вычеты:

Удержания на одного пассажира составили:
*плата в авиакомпанию за аннуляцию бронирования 1000руб. ( за 2-х пассажиров - 2000руб. )
*такса авиакомпании - 125руб. ( за 2-х пассажиров - 250руб. )
*сервисный сбор за оформление билета 100руб. ( за 2-х пассажиров - 200руб. )
*сервисный сбор за возврат 700руб. ( за 2-х пассажиров - 1400руб. )

Это при стоимости одного билета - 3600руб.

Читайте условия тарифа, по которому покупали билет.
Я думаю, не вернут вам ничего.

а причем здесь ваша беременность?!

Бывают вообще невозвратные авиабилеты (обычно - самые дешевые), какие-то возвращают по уважительной причине до полной стоимости (зависит от авиакомпании). К уважительным причинам относятся: отмена рейса, отказ в визе, болезнь (а беременность - это не болезнь. Если осложненная беременность - другое дело, но замучить справки собирать. Попробовать можно, но перед этим нужно четко знать, возвратен ли Ваш билет и на каких условиях)

Смотря какой тариф, могут вообще ничего не вернуть

Ищите в правилах конкретной авиакомпании, а именно тарифа, по которому был куплен билет. Также напишите в поддержку авиакомпании. Если летите S7, то вам ответят в течении суток, причем отвечают очень грамотно.