Скоро получу обменную карту в Москве, а рожать хочу в Хабаровске по месту прописки. Могу ли я выбрать роддом или нет?

родовой сертификат получите и рожайте где вздумается

Если есть обменная карта - в "инфекционку" уже не попадёте (туда кладут необследованных и женщин с признаками инфекционных заболеваний) . Если сертификат дадут - хорошо, если нет, то его выпишут в роддоме, где вы будете рожать. Отсутствие сертификата не влияет на возможность выбора роддома. Но скорая повезёт только в ближайший. Сами с началом родовой деятельности (схватки или отошедшие воды) можете ехать в любой роддом.
Если до родов ещё долго - в Хабаровске встаньте на учёт в местную ЖК. Если будет необходимость - могуту и направление в роддом дать.