После вируса на панели задач не видны свернутые окна и не работает кнопка Пуск. Вирусы почистила, но проблема не ушла.

Ваша проблема не нова и устранить ее можно следующим образом:
TaskMgr -> Новая задача -> Выполнить %systemroot%\explorer.exe
Перегружаемся.
Или:
TaskMgr -> Новая задача -> Выполнить "C:\Program Files\Internet Explorer\iexplore.exe"
В строке адреса пишем С:
Находим %systemroot%\explorer.exe и запускаем.
Или:
ctrl-alt-del - Диспетчер задач - Новая задача - regedit
Найти и удалить:
HKEY_LOCAL_MACHINE/SOFTWARE/Microsoft/WindowsNT/CurrentVersion/Image File Execution Options/explorer.exe
HKEY_LOCAL_MACHINE/SOFTWARE/Microsoft/WindowsNT/CurrentVersion/Image File Execution Options/iexplorer.exe
Перегружаемся.