Материальная помощь может быть в соответствии с нормативно-правовыми актами (Постановлениями Правительства например) . Это в государственных организациях. Там писать заявления не надо. Порядок выплат определен НПА.
Если Ваш руководитель перечислил Вам мат. помощь, то он будет отвечать за неё перед учредителями организации. Если Вы считаете, что мат. помощь это, так сказать, плата за молчание (уж извините и так бывает) , то лучше письменно от нее отказаться. Если руководитель хотел Вам искренне помочь, то Вы вправе не писать никаких заявлений. Поблагодарите руководителя устно.