как правильно доработать поршня на ваз 2107?

никак - поршни все одного веса должны быть. в этом то и проблема.
купи поршни если уж так хочешь с молибденовым напылением, поставь компрессор за 22 000 рублей это + 50 сил к двигателю и вперед.

а что ты там собрался дорабатывать? их на заводе доработали нормально.