Такую справку требуют обычно ФСС на основании п. 4 ст. 11.1 Закона о страховании: в случае если уход за ребенком осуществляется одновременно несколькими лицами, то право на получение пособия предоставляется только одному из них + пп \"д\" п. 54 Порядка назначения пособий, утв. ПРИКАЗОМ МИНИСТЕРСТВА ЗДРАВООХРАНЕНИЯ И СОЦИАЛЬНОГО РАЗВИТИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
от 23 декабря 2009 г. N 1012н.
Так что бухгалтерия вашего мужа в этом не виновата, им просто отказывают в выплате без этой справки. Если на работе мамы в выдаче такой справки откажут, то лучше обратиться в ФСС, пусть дадут официальный запрос, нужного документа. Им нужно подтверждение того, что мама не сидела на больничном по уходу за ребёнком одновременно с отцом. А вот почему такие справки требуют только для выплаты больничных отцам вопрос конечно интересный...