Нет особых отличий. Кар. порода лошадей известна лишь карачаевцам. Это разновидность кабардинской породы и выделять ее в отдельную невозможно.
Может, в половой принадлежности?
Кабардинская порода сформировалась в условиях содержания круглый год в табуне.
Летом - на горных пастбищах. Зимой её содержали в предгорьях и на
равнинах, лишь подкармливая сеном и зерном. По утверждению Ю. Н.
Барминцева (1972) кабардинская порода произошла в результате смешения
многих пород, в основном лошадей степных кочевников и пород южного корня
- персидской, туркменской, арабской.
https://ru.wikipedia.org/wiki/Кабардинская_порода_лошадей
Карачаевская порода выведена путем улучшения местных лошадей
чистокровными жеребцами. Табунное содержание карачаевских лошадей летом
на пастбище в горах, с сильно пересеченным рельефом при резких
колебаниях температуры и влажности, а зимой в предгорьях и на равнине с
незначительной подкормкой сеном способствовали выработке у этих лошадей
приземистости, хорошей подвижности, особой стойкости к невзгодам
существования.
https://ru.wikipedia.org/wiki/Карачаевская_лошадь