почему когда мы едим грушу, в ней встречаются твёрдые комочки

И что? Структура груши такая.

сорта груши разные, в одних нет грануляций ( твердых комочков) в других есть

Ну и что. Мне вообще кажется когда есть комочки она слаще и сочнее. Но это просто "кажется".

Потому что - это груша

ешь яблоки