Может ли судебный пристав наложить арест на банковский счет если на счету нет денег?

Конечно, не только может, но и обязан.... а вдруг денежка придет :-))) Арест накладывается в пределах суммы подлежащей взысканию. Если придет больше на счет то излишки останутся.