Вопрос про командировочные и их отчете

нет иного выхода из данной ситуации. либо отчитывайтесь, либо возвращайте. обязаны в течение 3х дней отчет предоставить по командировочным.
ну, еще, конечно, могут "простить" вам эти деньги, поставить в доход и взять с вас за них НДФЛ, но это уже на усмотрение работодателя.
на еду, к стати, суточные даются и за них не надо отчитываться. а командировочные даются на проезд и проживание, за них вы обязаны отчитаться.

1) в состав "командировочных" входят суточные.
Суточные не требуется подтверждать.
Они выдаются исходя из дней командировки включая время в пути (мин 700 руб/сутки. организация может назначить больше)
2) Еда не относится к компенсируемым расходам. На еду ты как раз тратишь суточные. Т. е. чеки на еду и не нужны - эти чеки тебе не зачтут

Ну со стороны законодательства необходимо отчитаться в течении 3-х дней либо возместить деньги. (Постановление от 13.10.2008 N 749)
Если восстановить документы не вариант, хотя можно попробовать, то нужно смотреть ЛНА вашего предприятия, нередки случаи когда работодатель устанавливает минимальную сумму расходов на проживание, которую не требуется подтверждать документально, по суточным, если вы действительно были в командировке, то документы предоставлять не нужно.
Ну и на крайняк, пишите заявление и с вас ежемесячно будут удерживать из заработной платы 20%. (ст. 138 ТК РФ)

Тут единственный выход - сделать чеки. Можешь попробовать договорится чтобы тебе прислали их как-то.