Выплата неустойки магазином

Ссылаясь на часть 2 пункта 2 и пункт 3 статьи 23.1 Закона РФ "О защите прав потребителей... " вы вправе потребовать уплаты вам неустойки в размере 0,5 % от суммы оплаты с момента окончания срока исполнения прописанного в договоре независимо от наличия дополнительных соглашений, если в них не прописан ваш отказ от требования неустойки с продавца.
Вы вправе в любой срок до поставки вам товара отказаться от исполнения данного договора и потребовать возврата оплаченных вами средств и выплаты неустойки в размере указанном мной.

Статья 23.1. Последствия нарушения продавцом срока передачи предварительно оплаченного товара потребителю
1. Договор купли-продажи, предусматривающий обязанность потребителя предварительно оплатить товар, должен содержать условие о сроке передачи товара потребителю.
2. В случае, если продавец, получивший сумму предварительной оплаты в определенном договором купли-продажи размере, не исполнил обязанность по передаче товара потребителю в установленный таким договором срок, потребитель по своему выбору вправе потребовать:
передачи оплаченного товара в установленный им новый срок;
возврата суммы предварительной оплаты товара, не переданного продавцом.
При этом потребитель вправе потребовать также полного возмещения убытков, причиненных ему вследствие нарушения установленного договором купли-продажи срока передачи предварительно оплаченного товара.
3. В случае нарушения установленного договором купли-продажи срока передачи предварительно оплаченного товара потребителю продавец уплачивает ему за каждый день просрочки неустойку (пени) в размере половины процента суммы предварительной оплаты товара.
Неустойка (пени) взыскивается со дня, когда по договору купли-продажи передача товара потребителю должна была быть осуществлена, до дня передачи товара потребителю или до дня удовлетворения требования потребителя о возврате ему предварительно уплаченной им суммы.
Сумма взысканной потребителем неустойки (пени) не может превышать сумму предварительной оплаты товара.
4. Требования потребителя о возврате уплаченной за товар суммы и о полном возмещении убытков подлежат удовлетворению продавцом в течение десяти дней со дня предъявления соответствующего требования.
5. Требования потребителя, установленные пунктом 2 настоящей статьи, не подлежат удовлетворению, если продавец докажет, что нарушение сроков передачи потребителю предварительно оплаченного товара произошло вследствие непреодолимой силы или по вине потребителя.

Игнорировать доп. соглашение, если оно подписано обеими сторонами (магазин и вы) не получится. А вот остальные бумажки рассматривать очень даже можно и нужно. Единственное, на них печать и подпись бы.