Как проходит вода по стояку с горячей водой?

Вентель можно постивить как вверху, так и внизу. Но тут нужно знать как именно подключен ваш полотенцесушитель, иначе вы рискуете перекрыть весь стояк полотенцесушителей и рециркуляцию ГВС. Так что возможно вентель ставить нельзя в принципе.

Полотенцесушители обычно делают просто как изгиб стояка ГВС - в этом случае он горячий весь год, кроме как в период летнего отключения горячей воды. Редко, но бывают полотенцесушители, запитанные от отопительной системы - они будут горячими только в отопительный сезон. Единственный раз я видел полотенцесушитель, включенный в сеть ГВС между подающим стояком и обраткой.
При самовольной замене изгиба стояка ГВС на хромированный полотенцесушитель, правильнее всего делать так. Допустим, стояк выполнен трубой 1 дюйм. Ставим вместо изгиба стояка отрезок прямой трубы (байпасс) диаметром 3/4" и в параллель с ним подключаем полотенцесушитель через два шаровых краника диаметром тоже 3/4" каждый. И, естественно, быстросъёмные соединения - "американки". При таком решении, суммарный просвет двух труб по 3/4" равен просвету трубы в 1" - Вы не заужаете стояк, не нарушаете водоснабжение Ваших соседей по подъезду. Если же Вам надо снять Ваш полотенцесушитель - например, прохудился он, это с ними бывает - то Вы перекрываете два шаровых крана и его снимаете, хоть и через заужение (байпасс) , но горячая вода продолжает поступать на нужды Ваших соседей - они, вероятнее всего, даже ничего не заметят.
Покуда всё это у Вас не сделано - для демонтажа Вашего полотенцесушителя необходимо не только перекрыть воду, но и, как говорится, "слить стояк" - не скупитесь, обратитесь к сантехникам! Учтите еще, что стояк ГВС обязательно имеет обратку, хоть Вы ее обычно и не видите - если перекрыть воду только с одной стороны, то вода на Вас польётся не из подающей трубы, так через обратку.

Я сам работал в составе бригады, делавшей всё это, но жену в ее новой квартире категорически отговорил от подобных затей: оставим просто изгиб трубы, как было сделано при построении дома - не надо искать себе лишних приключений! Наша бригада делала полотенцесушители вместо изгиба трубы стояка ГВС (хозяин хочет и платит, что ему станет на самом деле хуже - его дело! ) , но категорически просили, чтобы обрезал стояк и приваривал бйпасс и краники для подключения полотенцесушителя - тольк сварщик ЖЭК по официальному, через ЖЭК, платному вызову: если в результате реконструкции что-нибудь случится, то ЖЭК сможет винить только своих же рабочих, в противном случае, что бы ни случилось (пусть не по нашей вине) - виноваты окажемся мы (шабашники) и хозяева квартиры, ни нам, ни им это не нужно.

Надо ставить два вентиля . Так вам будет удобней если что просто взяли и перекрыли . Для ремонта или замены

ставить внизу на входной трубе

Честно говоря точно не знаю, но думаю, что снизу, трубы с горячей водой ведь под землёй проложены. Но, у меня, например такая конструкция полотенцесушителя, что если снизу я перекрою в нём воду, (нет общего стояка, в более современных домах видела - есть) , то у верхних квартир он тоже будет холодным.

внизу не поняли ---подробности в вопросе