моего сына удерживают в СИЗО уже 3 месяца не допрашивая правомерны ли действия следователя и сколько он так будет сидеть

Действия следователя неправомерны. Сыну следует обратиться в прокуратуру для проведения в отношении него проверки. Можно обратиться в суд в соответствии со ст. 125 УПК, так как волокита, допущенная следователем, нарушает право вашего сына на своевременное рассмотрение дела (разумный срок уголовного судопроизводства) .
Кроме того, срок содержания под стражей продляется каждый месяц через суд. В суде ваш сын может возражать против продления срока, мотивируя свою позицию допущенной следователем волокитой. В случае если суд все же продлит срок содержания под стражей, ваш сын может обжаловать постановление суда.
Удивляюсь, что это все еще не сделано

ну что， отпустили？

Выходить на следака надо, чего они мутят.

Меру присечения в СИЗО выносит суд. А не следователь. Срок, ОТБЫТЫЙ В СИЗО зачтеться при вынесении приговора по делу.

Значит проводятся иные следственные действия, помимо допроса обвиняемого.

Согласно статье 109 УПК РФ

2. В случае невозможности закончить предварительное следствие в срок до 2 месяцев и при отсутствии оснований для изменения или отмены меры пресечения этот срок может быть продлен судьей районного суда или военного суда соответствующего уровня в порядке, установленном частью третьей статьи 108 настоящего Кодекса, на срок до 6 месяцев. Дальнейшее продление срока может быть осуществлено в отношении лиц, обвиняемых в совершении тяжких и особо тяжких преступлений, только в случаях особой сложности уголовного дела и при наличии оснований для избрания этой меры пресечения судьей того же суда по ходатайству следователя, внесенному с согласия руководителя соответствующего следственного органа по субъекту Российской Федерации, иного приравненного к нему руководителя следственного органа либо по ходатайству дознавателя в случаях, предусмотренных частью пятой статьи 223 настоящего Кодекса, с согласия прокурора субъекта Российской Федерации или приравненного к нему военного прокурора, до 12 месяцев.

Срок содержания под стражей продлевается судом по ходатайству следователя - так что действия следователя здесь, ну никак, не назовешь неправомерными - потому что это не его решение.
Как сказано выше, постановление суда можно обжаловать.

Если он в СИЗО, значит к нему применена судом мера пресечения в виде ареста.
Однозначно правомерно.
То что с ним не проводят следственные действия (не допрашивают) , так это проблема следователя, который расследует уголовное дело в отношении вашего сына, а не ваша проблема.
К окончанию следствия вашего сына и допросят и с экспертизами ознакомят и с уголовным делом.

А что могут замутнить?

Срок предварительного следствия 2 месяца. Руководителем следственного органа он может быть продлен до 3 месяцев. Если же это дело сложное срок продлевается руководителем следственного органа по субъекту РФ до 12 месяцев.