Можно выписать с квартиры человека, без его ведома, если этот человек находится в местах лишения свободы?

Можно, в соответствии с п. 13 Административного регламента ФМС-
---------------------------
13. Снятие с регистрационного учета без непосредственного участия гражданина производится в случае:

призыва на военную службу - на основании сообщения военного комиссариата;

осуждения к лишению свободы - на основании вступившего в законную силу приговора суда;
---------------------------
==В данном случае снятие осуждённого с регистрационного учёта никак не влияет на его жилищные права.
-права собственности, само собой, он не лишается
-право пользования жилым помещением. если он проживао по договору соцнайма, - за ним сохраняется.
==Для снятия гражданина с регистрационного учёта, -представьте в паспортный стол копию обвинительного приговора суда.

Нет. Если квартира муниципальная, то он имеет равные права как и все остальные наниматели жилого помещения.
Если квартира находится в собствености и он является собственником или имеют доли, то снять с регистрационного учета нельзя. Если квартира в собственности и он не имеет права собственности в данном жилом помещение, а просто зарегистрирова, то собственник жилого помещения через суд может снять с регистрационого учета не собственника жилого помещения.

законно без его ведома не получится, оснований нет

я являюсь собственником мы решили продать квартиру и купить дом. но так как мой сын находится в млс мне не разрешают его выписать. он согласен на переезд И даже если потребуется он в письменном виде даст согласие. Я предаставила копию приговора в паспортный стол но получила отказ. Как мне поступить он не является собствинником