как выписать из купленной кооперативной квартиры бывшегожильца (не собственника), который сидит в местах лишения свободы

а не боитесь, что когда он выйдет ...то западло будет уже вам....

Предъявить копию приговора и его ОБЯЗАНЫ выписать. Это самый простой путь.

через суд

А что когда его посадили, его уже не сняли с регистрационного учета.

Как-то необдуманно Вы квартирку-то приобрели. Он снят с учета как осужденный, в справке о регистрации эта информация должна быть, после отсидки он вернется к Вам и будет решать с Вами вопрос о проживании. А там уж как суд решит. Когда вы составляли договор купли-продажи, как я понимаю, его посадку не описали, а между тем, существенным условием договора является перечень лиц, сохраняющих право пользования. Продавец утаил от Вас такую мелочь- на основании этого можно попробовать вернуть сделку обратно и возвратить уплаченные деньги. У убывших в СА и МЛС сохраняется право вернуться туда, откуда они убыли. При проведении сделки следовало взять у него заявление из МЛС о том, что ему известно о предстоящей продаже и он обязуется сняться с рег/учета и зарегистрироваться по новому месту жительства своей семьи (а с семьи обязательство его прописать) . Как вариант, можно попытаться взять у них эти заявления сейчас, но это мало чем поможет, если квартиру и продавали для того, чтобы избавиться от милого братца (или не братца) .
Не проверив сей факт, не изучив ситуацию Вы приобрели квартиру (если документы Вам показали поддельные, то это мошенничество) , под название "Добросовестный покупатель" Вы не подходите, посему побороться придется всерьез.