В случае если я после продаже доли, не обнаружу деньги в ячейке, можно будет как-то оспорить сделку?

Конечно же можно, расчет то не произведен.
Кража/хищение денег из ячеек банков, хоть и редко но случается.
Поэтому, если Вы открыли ячейку, а денег там нема - алгоритм действий примерно следующий:
1. - Не отдавать расписку о получении денег покупателю !!!
2. - Вызвать полицию !!!
3. - Ходатайствовать о возбуждении уголовного дела о мошенничестве, о краже будет ходатайствовать покупатель.
4. - Не подписывать акт приемо передачи недвижимости.
5.- Написать заявление в ЕГРП о наложении ареста на квартиру на основании п. 5 ст. 488 ГК РФ и в котором обязательно указать что расчет за недвижимость не произведен и акт приемо/передачи не подписан.
6. - Написать заявление в суд о признании ДКП недействительным в связи с не проведением расчетов (но тут возникает вопрос о цене иска и уплате пошлины) , и ходатайство о наложении обеспечительного ареста на недвижимость.
7. - Слушать и выполнять советы риэлтора.

Нет. Вы вместе с покупателем положите деньги в ячейку, после этого она будет закрыта и доступ к ней и покупателя и продавца будет невозможен. Так что все претензии по пропаже денег вы должны будете предъявлять депозитарию.

Вы же вместе с покупателем деньги закладываете и с ключами уходите

Обратите внимание - деньги хранятся до определенной даты, указанной в договоре аренды ячейки. Деньги надо взять ДО этой даты (не храните деньги от продажи доли квартиры в этой ячейке) . После этой даты доступ к ячейке имеет также и покупатель.

Ячейку нужно арендовать на длительный срок, чтобы в случае затягивания регистрации не выйти на последние 3 дня аренды, когда покупатель может и деньги забрать и долю приобрести ( без регистрации он уже является собственником, подписав у нотариуса договор купли - продажи. . См. поправки к ГК РФ от 1 марта 2013 года)

Банк не несет ответственности, что находится в ячейке. Лучше сделать опись к договору аренды индивидуального банковского сейфа.

Измените в тексте договора условия оплаты на более приемлемые и стандартные.

тогда вопрос к банку

пригласите опытного агента, который проследит правильность составления договора аренды ячейки. из ячейки деньги не пропадают