Если человек долго не живет в муниципальной квартире его можно как то выписать ?

признать его без вести отсутствующем, через суд

Коммуналку оплачивает?

Если жилье единственное, то выписать не возможно.
Исключение составит тот нюанс- если по суду вы признаете человека безвестно отсутствующим., но для этого вы должны были подать на его розыск.

Вы хотите, что бы он вернулся в свою квартиру и жил там, вам без него плохо живётся? Ну придёт, приведёт с собой семью, вам легче будет?

Там нет однозначного ответа. Тем более если отсутствуют задолжности
по оплате за все предоставляемые услуги. Понятно что вода+свет по счётчику.
Но остальное то тоже надо оплачивать.
Потом появляется ли он? Или вообще уже нет данный период времени.
Когда - то было положение, что при отсутствии человека в течение
6 месяцев, можно было снять с регистрации . Основание : проживает
в другом месте и в жилплощади не нуждается.
Сейчас рассматривать сложно из-за неполных данных .
Кто Вы? Заинтересованное лицо? Соседка? Родственник ?

Он за нее платит?

только в судебном порядке, признавать безвестно отсутствующим не обязательно

Отличный вопрос. Я вот не живу дома много лет.. Плачу за коммуналку.. Родные дёрнулись меня шантажировать что выпишут, а вот хрен. Только в судебном порядке.. И главное чтоб квитанции об оплате квартиры были на руках..
Другое дело, если человек пропал без вести, не платит за квартиру, то может и можно.. Хотя опять же сомневаюсь что всё так просто..

МОЖНО ПРИЗНАТЬ УТРАТИВШИМ ПРАВО ПОЛЬЗОВАНИЯ КВАРТИРОЙ. еСЛИ ВЫЕХАЛ ДОБРОВОЛЬНО, ВЕЩЕЙ ЕГО В КВАРТИРЕ НЕТ, КОММУНАЛКУ НЕ ОПЛАЧИВАЕТ.... КАЖДЫЙ СЛУЧАЙ ИНДИВИДУАЛЕН.