Через какое срок можно продать квартиру принятую по наследству, чтобы не платить налог? В квартире не прописан никто.

после подачи декларации... т. е. после первой уплаты налога: ) увы это страна такая

Через три года после вступления в права наследования.

Или в договоре указывать сумму не более 1 000 000 руб.

Согласно НК РФ Статья 220. Имущественные налоговые вычеты
1. При определении размера налоговой базы в соответствии с пунктом 2 статьи 210 настоящего Кодекса налогоплательщик имеет право на получение следующих имущественных налоговых вычетов:
1) в суммах, полученных налогоплательщиком в налоговом периоде от продажи жилых домов, квартир, включая приватизированные жилые помещения, дач, садовых домиков или земельных участков и долей в указанном имуществе, находившихся в собственности налогоплательщика менее трех лет, но не превышающих в целом 1 000 000 рублей
При продаже жилых домов, квартир, включая приватизированные жилые помещения, дач, садовых домиков и земельных участков и долей в указанном имуществе, находившихся в собственности налогоплательщика три года и более, а также при продаже иного имущества, находившегося в собственности налогоплательщика три года и более, имущественный налоговый вычет предоставляется в сумме, полученной налогоплательщиком при продаже указанного имущества.

Если продавать указывая рыночную стоимость, то 3 года, если указать1000000то можно сразу после вступления в наследство, а расписку получить 1- цена договора, 2-я на разницу продажи в реальности...

Чтобы иметь право распоряжаться "наследством", надо вначале заплатить налог (первоначальный взнос) , а уж потом делать со СВОЕЙ квартирой всё, что Вам заблагорассудится. Но (!) имеются и варианты. Однако - чреватые непредвиденными расходами.