Подскажите, как должен мне оплачиваться больничный лист по заболеванию и входит ли служба в общий трудовой стаж?

Больничный, конечно обязаны оплатить в любом случае.

Используется для больничных страховой стаж, в который кроме работы по трудовому договору (но только с 2010 года) засчитываются периоды прохождения военной службы.

По состоянию на 2009 год больничный вам должны оплатить на 60%, а после 01.01.2010г. - на 80%.

Сейчас порядок оплаты больничных листов значительно упрощен - за основу принимается не непрерывный, а общий трудовой стаж. (понятие "непрерывный" уже уходит в историю) . А любое прохождение военной службы (по призыву или по контракту - неважно) обязательно включается в общий трудовой стаж. Итак, у вас с мая 2001 по февраль 2003 - 1 год 9 месяцев (дни отброшены, так как вы не указали точные даты) . Затем с февраля 2003 по апрель 2004 - 1 год и 2 месяца, а затем с ноября 2005 по декабрь 2009 - 4 года 1 месяц, а всего 7 лет. Это тот общий трудовой стаж (от 5 до 8 лет) когда вам положена оплата больничного листа в размере 80% от заработка

Все зависит от того сколько у вас трудовой стаж: вообще по законадательству вам обязаны оплачивать больничный лист. если трудовой стаж более 8 лет - 100% из официального оклада, от 6 лет 80%, менее 60%. Армия и служба по контракту должны входить в тудовой стаж.