Была ревизия. Выявлена недостача. Директор, подозревая, отстранил меня от работы и сказал, что не отдаст трудовую, пока

В данном случае если у вас заключён договор надо сделать следующее:
1. Сразу обратится в комитет по труду, там написать заявление. (уверяю директору "мало не покажется)
2. Ходить на работу как ни в чём не бывало. (это нужно что бы были свидетели что вы были на работе желательно что бы ещё и какие нибудь подписи ставили на рабочих документах)
3. Если кто-то препядствует к выполнению своих служебных обязанностей, то попросить что бы это лицо дало вам объяснение в письменном виде число и подпись обязательна.
Это все для того что бы вам выплатили всю заработанную плату за весь период до того пока у вас не окажется трудовая книжка в руках.
О выплате недостачи нет и речи, потому что не было решения суда. Это решает только суд.
Если не было трудового договора то заявление подается в РОВД по месту жительства. (будет просто изъятие трудовой книжки. Можно конечно подать и в суд на то что директор не выплачивал зарплату и удерживал трудовую если он скажет что выплачивал и докажет, то тогда им заинтересуется налоговая инспекция т. к не было трудового договора. В общем к нему в любом случае будут вопросы от органов власти.
Вывод:
1. Наше дело правое!
2. Зря он заварил эту "кашу"

Чем он Вам там пригрозил? Пока Вы что? Пока не погасите недостачу, так у него облом, не по адресу, если Вы не согласны. Кроме того, какой трудовой договор Вы подписывали? А был ли договор о полной материальной ответственности? А правильно ли проводилась ревизия?

Ваш директор не прав. В письменном виде предложите ему выдать вам трудовую в соотвествии с положениями ТК РФ, в противном случае, пока он разберется кто допустил недостачу, вы разберетесь с ним в суде по факту нарушения им Трудового Законодательства с требованием компенсации за моральный вред тысяч на 50-100.Удачи вам.