В чём разница между увольнением по собственному желанию и по соглашению сторон,какая предпочтительней ?

Расторгнуть трудовой договор по соглашению сторон работник может в любое время. Это значит, что, с одной стороны, он может уволиться «одним днем» и не будет отрабатывать две недели, как это требуется при подаче заявления об увольнении по собственному желанию. С другой стороны, поскольку условия такого соглашения стороны вольны определять по своему усмотрению, датой фактического прекращения трудовых отношений может быть определен иной день, нежели дата подписания самого соглашения. При увольнении работника по собственному желанию он в любое время до даты увольнения вправе отозвать свое заявление. В случае же расторжения трудового договора по соглашению сторон если работник после подписания документа вдруг передумает, то аннулировать данное соглашение можно будет только по взаимному согласию сторон (п. 20 постановления Пленума Верховного суда РФ от 17.03.04 № 2 «О применении судами Российской Федерации Трудового кодекса Российской Федерации» , Определение Конституционного суда РФ от 13.10.09 № 1091-О-О) . То есть в одностороннем порядке его расторгнуть крайне сложно.
Заранее предупреждать другую сторону о намерении расторгнуть договор не нужно. Уволить работника по соглашению сторон можно в том числе в период временной нетрудоспособности или нахождения его в отпуске

По соглашению возможна компенсация, и срок оговаривается

По соглашению сторон можно уволиться и в день написания заявления. По собственному желанию, только со следующего дня и здесь не учитывается желание работодателя.

При увольнению по соглашению, особенно если работодатель желает быстренько избавиться от работника, работник может выпросить себе компенсацию в разумных пределах, разумный предел определяется именно по соглашению, проще сказать - торгуются ребята, как на базаре.

Трудовой договор может быть в любой момент прекращен по соглашению сторон (ст. 78 ТК РФ) . Инициатором расторжения договора по данному основанию может являться как работник, так и работодатель. Договоренность сторон оформляется путем составления отдельного документа - соглашения о расторжении трудового договора. В соглашении нужно отразить дату (т. е. последний день работы) и основание расторжения договора (соглашение сторон) .

Особенностью прекращения трудового договора по соглашению сторон является то, что его отмена возможна только при взаимном согласии сторон. Иначе говоря, после того как соглашение об увольнении подписано, ни одна из сторон не может его отозвать. Поэтому для работодателя прекращение трудового договора по данному основанию является наиболее приемлемым и безопасным при решении сложного кадрового вопроса.
В Определении Конституционного Суда РФ от 13.10.2009 N 1091-О-О указано, что соглашение о расторжении трудового договора может быть аннулировано только по согласию сторон, что исключает возможность односторонних действий, направленных на отказ от ранее достигнутой договоренности.