Как правильно и грамотно обжаловать выговор, объявленный руководством, с моей точки зрения вынесенный формально

Обжаловать и отменить дисциплинарное взыскание можно несколькими способами.
1.Лучше всего начинать с переговоров. В случае, если Ваши позиции крепки, Вы имеете на руках документы, подтверждающие непричастность к проступкам, видите, что выговор оформлен неверно, - поговорите с непосредственным начальником, кадровиком или директором. Объясните, что закон на Вашей стороне, что проще отменить выговор, чем потом проиграть дело в суде.
2. Если в Вашей организации есть профсоюз, то обжаловать вынесение выговора можно с его помощью. В некоторых компаниях работают комиссии по трудовым спорам. Чтобы заручиться их поддержкой, необходимо составить заявление в свободной форме и указать в нем суть Вашей проблемы во всех подробностях.
3. Еще одна инстанция, которая сможет Вам помочь, - местное отделение госинспекции по труду. Ну а если дойдет до суда, помните, что при рассмотрении трудовых споров работник освобожден от уплаты госпошлины. Лучше, если Вы не просто отдадите справки начальнику лично в руки, а официально оформите их передачу через отдел кадров или канцелярию с отметкой о вручении. Это обезопасит Вас от их внезапной «пропажи» .
Кстати, если в течение года после выговора работник не будет подвергнут новому наказанию, то он считается не имеющим дисциплинарного взыскания. А до истечения года работодатель имеет право снять взыскание с работника, если он не допустил нового нарушения трудовой дисциплины и проявил себя как добросовестный сотрудник.