Но ведь 05.11.12 и так выходной день. В приказе написала, что по 04.11.12, т. к 05 и так выходной автоматически.

PS Я Вам уже ответила один раз, но мне за мой ответ поставили1. Теперь я нашла статьи трудового кодекса. прочитайте.

Трудовой кодекс РФ
c комментариями.

Комментарий к статье 120
§ 7. Если окончание отпуска приходится на выходные дни, установленные графиком работы, то работник должен приступить к работе в свой первый рабочий день по графику.

Продолжительность ежегодного отпуска в 28 календарных дней отсчитывается по календарю. Статья 14 Трудового кодекса РФ определяет, что в срок, исчисляемый в календарных днях, включаются и нерабочие дни. Поэтому по календарю отсчитываем подряд 28 календарных дней, включая субботы и воскресенья.

Но при подсчете дней ежегодного отпуска надо иметь в виду еще одно правило (ч. 1 ст. 120 ТК) : нерабочие праздничные дни, приходящиеся на период ежегодного основного или ежегодного дополнительного оплачиваемого отпуска, в число календарных дней отпуска не включаются. То есть если нам при подсчете попадается нерабочий праздничный день (все праздники перечислены в ст. 112 ТК) , то мы этот день "перешагиваем" и продолжаем считать дальше. Таким образом, за счет праздничного дня отпуск работника увеличивается и составляет уже фактически не 28 дней, а 29 дней.

он не "автоматически" , а переносом 4-го.
Далее, работничек у Вас может и по графику трудиться. У которого "выходные" с календарем могут не совпадать.

А в чем вопрос? У кого-то, например, у врачей, 5 ноября - рабочий день.

В приказе необходимо указать по 05 ноября! Иначе, количество дней отпуска считается 27, 20, 13 или 6 дней.