Московские станции метро связанны?

Разумеется, метрополитен - единая система. Некоторые пересадочные узлы (АВиамоторная, Электрозаводская) недостроены - там переходить через улицу, но без дополнительной оплаты, если после входа прошло менее 90 минут. Но можно построить маршрут по-другому.

Выходить из поезда придется
Выходить из метро - нет
Для пересадки на МЦК или МЦД - придется выходить из метро

Вроде да.

сможешь с пересадками
https://yandex.ru/metro/moscow?focus=0&scheme_id=sc34974011

связаны

Да, все станции московского метрополитена являются связанными (речь идёт только о самом метро, вне связи с МЦК и МЦД).

Это значит, что для пересадки с одной линии на другую Вам не нужно выходить в город, проходить через зону турникетов ещё раз и, следовательно, не нужно заново оплачивать проезд. Почти все пересадки осуществляются внутри сети метро без выхода на поверхность. Единственные условные исключения - наземные пересадки между станциями Авиамоторная Калининской и Некрасовской линий и Электрозаводская Арбатско-Покровской и Некрасовской линий. Здесь пересадка осуществляется с выходом на поверхность и проходом заново в зону турникета, но без повторной оплаты проезда. И то - теоретически можно перемещаться между этими станциями и без выхода на поверхность (через другие линии), хотя это и менее удобно.

Что касается МЦК и МЦД (обозначены на схеме не сплошными линиями, а двойными тонкими линиями), то там пересадка осуществляется с повторным проходом через зону турникетов и за редким исключением (например: Ленинский Проспект - Площадь Гагарина), по земле. Иногда эти пересадки длинные и неудобные (как, например, пересадка Панфиловская - Октябрьское Поле). Все такие пересадки бесплатны в течение 90 минут с момента первой активации проездной карты или билета (каждая платная активация запускает отсчёт этих 90 минут).

Для выхода со станций МЦД нужно дополнительно приложить проездной документ к турникету, в том числе и для осуществления пересадки (для выхода со станций МЦК и метро этого делать не нужно).

Чисто теоретически можно один раз оплатить проезд в метро, пройти через турникет и объездить хоть все линии в пределах одной поездки (кроме МЦК и МЦД).

В систему скоростного транспорта Москвы (метро + МЦК + МЦД) входит ещё монорельс (линия 13 на схеме). Но он работает в экскурсионном режиме (интервалы движения составляют 30 минут). Функционально (по системе оплаты проезда и пересадок) работает так же, как и МЦК.

связаны

да сможете

В метрополитене не только станций, но и веток/линий много =)
Если вам нужно добраться (из точки A в точку B) которые находятся на одной ветке/линии, то естественно доедете без пересадок, но если (точка B) находится на другой ветке/линии, то нужно совершать обязательную пересадку, иначе никак.
Нужно просто изучить схему метрополитена и на указатели обращать внимание.
**
Также в МСК есть как наземное, так и подземное метро
(Наземное метро обслуживает ОАО. РЖД, а подземное метро обслуживает ГУП. МосМетро).
Наземное метро относится к МЦД и МЦК.

Все станции метро связаны между собой в единое целое. Можно сказать, что метро- это подземный город, а линия- это улица. Как и в любом городе улицы пересекаются между собой, образую перекрёстки, которые в метро называются пересадками.

На сколько я знаю, да