Пожалуйста. Объясните порядок нахождения в служебной командировки у военнослужащих.

Скорее всего, если начальство уперлось, вы уже не докажете это. Только озлобите начальство.
Хотя начальство ваше и нарушает требования закона.
Ведите сами этот учет. По возвращении из командировки напишите рапорт о предоставлении дополнительных дней отдыха.
Если не удовлетворят, обращайтесь в суд. Исходя из практики судов, такие требования военнослужащих удовлетворяются в полном объеме.
Правовые основания для этого есть.
Некоторые вопросы относительно командировки изложены в указанном приказе МО РФ.
316. Военнослужащие направляются в служебные командировки по распоряжению командира (начальника) на определенный срок в другую местность для выполнения служебного задания вне пункта постоянной дислокации или временного расквартирования воинской части (подразделения) , в которой военнослужащий проходит военную службу.
Военнослужащим, направляемым в командировку, производятся выплаты на командировочные расходы (возмещаются расходы по бронированию и найму жилого помещения, проезду к месту командировки и обратно к месту службы, а также выплачиваются суточные) .
323. Командировки могут назначаться военнослужащим на срок свыше 40 дней, но не более чем на один год, в следующих случаях:
в) на монтажные и наладочные работы; для приемки, сдачи или ремонта кораблей и судов;
331. Не считаются командировками поездки военнослужащих:
б) в составе воинской части, кроме случаев, указанных в подпунктах "а" и "б" пункта 323 настоящего Порядка;
в) в составе подразделений воинских частей, кроме случаев, указанных в пункте 323 настоящего Порядка;
Приказ Министра обороны РФ от 30.06.2006 N 200 (ред. от 03.06.2011)
"Об утверждении Порядка обеспечения денежным довольствием военнослужащих Вооруженных Сил Российской Федерации"

Служебная командировка НЕ входит в Перечень мероприятий, которые проводятся без ограничения общей продолжительности еженедельного служебного времени военнослужащих, а это значит, что нахождение в служебных командировках не является мероприятием, проводимым без ограничения общей продолжительной еженедельного служебного времени военнослужащих.
Согласно п. 1 ст. 11 Федерального закона "О статусе военнослужащих" общая продолжительность еженедельного служебного времени военнослужащих, проходящих военную службу по контракту, за исключением случаев, указанных в п. 3 данной статьи, не должна превышать нормальную продолжительность еженедельного рабочего времени, установленную федеральными законами и иными нормативными правовыми актами Российской Федерации. Привлечение указанных военнослужащих к исполнению обязанностей военной службы сверх установленной продолжительности еженедельного служебного времени в иных случаях компенсируется отдыхом соответствующей продолжительности в другие дни недели. При невозможности предоставления указанной компенсации время исполнения обязанностей военной службы сверх установленной продолжительности еженедельного служебного времени суммируется и предоставляется военнослужащим в виде дополнительных суток отдыха, которые могут быть присоединены по желанию указанных военнослужащих к основному отпуску.
Федеральный закон от 27.05.1998 N 76-ФЗ (ред. от 12.12.2011)
"О статусе военнослужащих"

почитай на сайте минобороны положение о порядке прохождения военой службы и приказ мо этого года о компенсации сверхурочного времени

гни свою линию