Гитара не строит Начинаю настраивать третью струну, а на тюнера показывает, что строю 4 Что делать?

выкинь тюнер нах... всю жизнь гитару строили по первой струне.
первая, по ней вторая, по второй третью и т. д.

Я не уверен, что тюнер работает правильно так как такой разбег по частоте просто не реален. Попробуйте настроить приблизительно на слух, а потом тюнером. Если будет то же самое, пробуйте заменить струну. Помните, что нейлоновые струны строятся на тон ниже металлических. То есть первая струна строится не на Ми, а на Ре. Иначе будете рвать струны постоянно и, что ещё хуже, появляется опасность отрыва подставки нижнего порожка от деки. Особенно на не дорогих гитарах. Не ставьте на классику металлические струны.
Кроме того есть сомнения в правильности строя гитары. Я отремонтировал черниговскую гитару и стал её строить. Оказалось, что гриф настолько криво расчитан, что пришлось ставить на гитару тейл с креплением на обечайку и не клеить подставку нижнего порожка, чтобы сдвинуть порожек гораздо ниже, нежели был установлен до ремонта и порожек наклонить значительно, чтобы верхние струны строили на 12 ладу. И я уверен в том, что если заменить струны на другой калибр, то строить придётся заново. Как бы Вам не пришлось гитару нести гитарному мастеру для настройки. Это стоит денег, но куда деваться. И пусть мастер заменит порожки на костяные. Вы удивитесь насколько изменится звучание гитары.

А без тюнера религиозные убеждения не позволяют?

На самом деле может быть банальная проблема. Это высота струн на нулевом порожке. Вот видеосюжет, где подробно рассказано как решить проблему. Собственно видео - https://youtu.be/dqx747ASMVM