Какие противоречия и нестыковки содержит теория эволюции Дарвина ?

Теория эволюции Дарвина держится на факте, недоказанном никем в мире, а именно, превращение неживой материи в живую клетку и организм, поэтому уже хромает на обе ноги.

Никаких проблем и нестыковок. Все давным-давно доказано сотнями тысяч фактов.

проблемы именно теории Дарвина - он сам и привел, креационисты уже полтора века его повторяют.

после появления генетики и развития палеонтологии - проблем не осталось.

а уж сегодня и говорить не о чем, мутации видны на анализе ДНК, теория эволюции остается только "верхнеуровнневым" описанием того, что раскрыто до самого фундамента.

Исходная версия содержала в себе противоречия и нестыковочки, которые были вызваны главным образом полным незнанием механизмов и процессов наследственности. Все они были преодолены позже, с появлением генетики. Современная версия, свободная от нестыковочек называется Синтетическая Теория Эволюции: https://ru.wikipedia.org/wiki/Синтетическая_теория_эволюции

есть, например, Ньютон
его юношеский реферат под названием НАЧАЛА, написанный им на 2-м курсе колледжа, описывал достижения ученых того времени
но...
ныне все написанное в этом реферате приписывают лично Ньютону

примерно то же самое и с Дарвином, которому приписывают эволюцию
на самом деле, Дарвин выдвинул гипотезу естественного отбора

гипотеза эволюции давно признана антинаучной https://cont.ws/post/100222

Главный фактор эволюции биологических видов на Земле это среда обитания. Можно даже сказать, что биологические виды это продолжение среды обитания. У среды обитания есть параметры, такие как температура, давление, влажность и прочие. Планета Земля находится в постоянной звездной эволюции, она движется в пространстве, удаляется от Солнца и как следствие меняются состав атмосферы, сила притяжения, давление, температура... и все эти изменения в свою очередь плавно меняют и живые организмы на Земле. Изменение среды обитания вносит в генетический код свои так сказать поправки, которые называют "наследственными признаками". Другое дело, если условия среды обитания изменятся резко, например в следствии катаклизма или столкновения Земли с большим небесным камнем.. При резких изменениях среды обитания процесс эволюции просто "не успеет" изменить вид... ведь изменения происходят в течении смены многих поколений... Это можно сравнить с резким и медленным подъемом водолаза на поверхность... Если он резко будет всплывать то это может привести к смерти, а если медленно то безопасно..