Если в ИСО рассматривать столкновение двух шариков, будет ли в этом случае меняться импульс и энергия Земли?

Конечно, Земля же обращается вокруг Солнца... Да и Луна тоже ее притягивает.
Или под двумя шариками имеются в виду Земля и гипотетическая Тейя?
PS. Вы, сударь, офигительно понятно вопрос сформулировали.

Если она является одним из этих двух шариков, то конечно.

математика примитивна
на настоящий момент такая математика не способна описать наш сложный, реальный, обьемный, Неинерциальный мир

потому то и придумана ИСО = 2-х мерная (плоская, на листке бумаги) модель нашего мира

ученые специально отмечают = … инерциальные системы… в природе не существуют… ru.wikipedia.org/wiki/Инерциальная_система_отсчёта

Система отсчета инерциальная, правильно? Считайте, что сила гравитации, включая земную выключены. Проще говоря, вы вместе с шариками падаете в лифте. Акт столкновения шариков можно считать точечным, поэтому на их столкновения Земля повлиять не может, а они в свою очередь на Землю. После разлета может случиться все что угодно. Например, один из шариков вылетит из лифта и упадет на землю.

будет. на такую величину, что её изменением можно пренебречь. приведу аналогию. получает Александр Сошин зарплату. Допустим в 1 миллион рублей ежемесячно. так вот изменение импульса и энергии земли в таких манипуляциях будут подобны увеличению зарплаты Александра Сошина на одну десятимиллионную копейки раз в год. т. е. Александр Сошин этого не почувствует даже за несколько миллиардов своих жизней, такие дела

трение между чем и чем?