А есть версия, что ведьмы, на которых охотились, это просто тогдашние ученые, которые пытались двигать химию и биологию?

Люди просто устраняли тех,кто им не нравился или был "не удобен".
Хотя и такой расклад можно рассматривать.

Именно так и было !
Их только в детских книжках страшными старухами рисуют..

Нет, конечно, речь шла о женщинах, которые в ту пору НЕ занимались наукой, а лишь ворожбой и предсказаниями. Для проверки ведьм существовал весовой барьер. Считалось, что женщины весом менее 50 кг легко могут попасть в дом через форточку.

Ведьма - это та, которую кто-то обвинил.
"Если кто-нибудь стоял один в поле во время грозы, как раз на том месте, где она прежде всего разразилась, то его уже сильно подозревали — потому что для чего ему было там стоять, если он не хотел вызывать грозы? Если женщина хвалила или ласкала скотину, заболевшую впоследствии, или если она внезапно заговорила с человеком, или исподлобья на него посмотрела и он заболевал, то виновницей этих заболеваний была несомненно эта женщина. Раз существовало подозрение, все считалось знаком виновности. В одном процессе 1665 г. свидетельница показала, что подсудимая обтерла себе рот после причастия при обходе вокруг алтаря. На основании одного этого показания подсудимую обвинили в намерении превратить вынутый изо рта кусочек просфоры в колдовские средства и присудили к смертной казни."
Инквизитор Фридрих Шпе, 1631 г.:
"Если обвиняемая вела дурной образ жизни, то, разумеется, это доказывает её связи с дьяволом; если же она была благочестива и вела себя примерно, то ясно, что она притворялась, дабы своим благочестием отвлечь от себя подозрение в связи с дьяволом и в ночных путешествиях на шабаш. Если она обнаруживает на допросе страх, то ясно, что она виновна: совесть выдаёт её. Если же она, уверенная в своей невинности, держит себя спокойно, то нет сомнений, что она виновна, ибо, по мнению судей, ведьмам свойственно лгать с наглым спокойствием. Если она защищается и оправдывается против возводимых на неё обвинений, это свидетельствует о её виновности; если же в страхе и отчаянии от чудовищности возводимых на неё поклёпов она падает духом и молчит, это уже прямое доказательство её преступности"

Алхимики вроде Альберта Великого.вынуждены были мимикрировать под богословов и прочих схоластиков.

а бог шестеренки тогда не запрещал, поэтому и не трогали

Нет, скорее "ведьмы" это социально неприемлемые категории людей которых общество тех времен могло уничтожить, ведь и нищих обвиняли в колдовстве и сумасшедших и вообще просто слишком самостоятельных женщин. Ну а были ли среди них ученые то скорее нет т.к. естественных наук тогда еще не было. Например, и алхимия и химия используют одинаковое оборудование, например реторту, но принципиальная разница между ними в методах познания. Алхимия использует философский метод, химия естественнонаучный. А раз нет науки то нет ученых. Если же считать алхимию донаучной химией, а алхимиков учеными, то да, тогда среди ведьм были и ученые.

рисовать можно хоть что и хоть как. но сжигали обычных крестьянок

В истории уголовных кодексов многих стран была статья "делать непонятное". За это сжигали на кострах и иными способами лишали жизни...

Людей всегда пугало то, что они не могут объяснить. И если они сжигали Джордано Бруно, посадили в тюрьму Галлилея (которые и были физиками, по крайней мере Галлилей), чем хуже алхимики? ну хотели они превратить руду в золото, попутно прокачивая алхимию. Какая-то баба подумала, что от этого у нее молоко скисло и вуаля! Наш алхимик на костре.