При записи CD-R какого формата лучше использовать первоначальные файлы (mp3,flac) и влияет ли это на качество музыки?

Конечно, влияет. Мр 3 - это сжатые файлы с потерей качества звука, с меньшим размером файла. Их можно перекодировать в WAVE файл, но качество не улучшится. Вы же не сможете из консервы получить кусок мяса? FLAC - это сжатие без потерь, но с большим размером файла. Если вы хотите получить диск, который будет воспроизводиться на любом проигрывателе, вам необходимо исходные сжатые файлы развернуть в WAVE формат.

Цифра остается цифрой. Так что формат не важен. Вопрос в том, ЧТО вы хотите получить в итоге - AudioCD или же DataCD? Если у вас абсолютный слух (слышите частоты выше 16 кГц), а акустика качественная, то тогда mp3 в пролете.

Самый лучший Формат (FLAC или APE - это сжатый исходный формат WAV)
на диске будет как Audio CD
он без потери качества... далее по убывания качества - MP4 AAC MP3
--------------------------------------------------------------------------------------------
открою маленький секрет... сейчас есть кодеки мр3 которые по слуху как исходный формат
я сам был в шоке! вот программа с этим кодеком - BigasoftAudioConverter

Если нужно записать достаточное количество файлов, то для этого носителя не целесообразно использовать форматы с небольшим сжатием. Человеческий слух не различает форматы.

максимальное качество - FLAC!!!

Обычно на cd диски записывают mp3 высокого качества. Для экономия на дисках, заказывай оптом. Купить можешь на этом сайте http://cdbrand.ru